雖然線上交易持續在成長中，然而許多消費者仍對安全機制表示存疑。在10日舉辦的「電子商店驗證組織聯合成果發表會」中，主辦單位經濟部商業司指出，電子商店的驗證機制是本年度「電子商務環境整備及B2C電子商務推動計劃」的重點項目之一，認證系統的建置將能創造更具可信度的電子商務環境。目前國內主要的電子商務識別系統以KPMG的「SysTrust」及SOSA網路信賴標章為主。

為解決電子商務推廣的安全障礙，多家電子商店業者呼籲政府儘速解決線上交易盜刷問題，建立買賣雙方間公平安全的交易環境，電子商務環境才能蓬勃發展。與會業者指出，目前有高達一成的盜刷率，這也是推廣網路交易的最大障礙。由於買賣雙方無法在虛擬的網路平台上見面，因此如何消除安全上的疑慮，也就成了擴大線上交易規模的瓶頸。