根据CNET网站报导指出，使用RFID不仅存在隐私权争议，商家也可能面临安全防护上的问题，德国DN-System Enterprise Solutions GmbH的资深顾问Lukas Grunwald表示，这种科技可能被黑客和精通科技的扒手滥用。

低成本的RFID卷标已经普遍被零售商用为追踪存货的方式，有许多比美国的五分镍币更小且更便宜，虽然面临最大威胁的是消费者的隐私，但小偷也可能藉此改变商品的项目名称，欺骗商家。

Lukas Grunwald在拉斯韦加斯举行的黑帽安全简报（Black Hat Security Briefings）中表示，RFID为扒窃和混乱攻击开启了一个全新的领域，这对公司而言形成一大风险。过去由于阅读RFID的硬件费用高昂，软件也难用，所以延缓了这个领域的安全研究，但目前已开发的新软件工具已经可以用来读取和改编无线电卷标。当这类工具广泛传播后，黑客和居心不良人士可能利用掌上型装置搭配软件，将昂贵的商品改成便宜的项目，经由自助柜台带走。

Grunwald的软件程序RFDump可轻易重编RFID。虽然该程序有被严重恶意使用的可能，消费者也能用它来自我保护。Grunwald指出，每个人都有权利在离开商店的时候消除RFID卷标。删除卷标上的信息能够阻止商店和其他地方设置RFID检查点，追踪人们携带了哪些产品，或在皮肤下嵌入哪些东西。

此外，加密技术虽可用来阻挡未授权的窥探者取得数据，但目前只有少数RFID芯片能够处理压入加密钥等较复杂的工作。能作加密工作的RFID卷标往往也是市面上最昂贵的产品，一般杂货店较难负担得起。利用RFID卷标上无法更改的标号，店家可以设置一台数据库服务器来追踪商品，但也会造成这类科技的应用更加复杂。Grunwald认为，店家使用RFID技术的同时，对这项科技的了解仍不足。