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GARAOTUS提供MedGenome基因组分析整体解决方案
 

【CTIMES / SMARTAUTO ABC_1 报导】    2022年07月26日 星期二

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精诚集团旗下高速运算(High Performance Computing, HPC)品牌GARAOTUS,基於弹性且高效的运算能力所设计出的基因组分析解决方案,协助印度MedGenome医疗机构,大幅提升MedGenome在罕见疾病和帕金森氏症,以及其他领域的研究所需的运算能力,共同为生医研究领域做出贡献。

GARAOTUS获美国全球企业领袖杂志评选「2022全球前30大瞩目企业」之一
GARAOTUS获美国全球企业领袖杂志评选「2022全球前30大瞩目企业」之一

GARAOTUS携手伟萨科技、研华科技及英特尔,提供印度医疗机构MedGenome基因组分析整体解决方案。该解决方案整合了GARAOTUS自行研发HPC平台,CRONUS Service Fabric及CRONUS Orchestration,并搭配研华科技提供的高效能及稳定的硬体架构,以及伟萨科技提供的程式化逻辑闸阵列FPGA(Field Programmable Gate Array)结合基因定序分析的加速解决方案,有效协助MedGenome提升疾病研究效能达89%。

MedGenome是一家总部位於美国德拉瓦州的印度医疗机构,并在 2018 年获得了生物医学突破奖(MedTech Breakthrough Award),其生物资讯学??总裁Ravi Gupta表示:「我们的医生和研究人员对该解决方案展现的效能及成本比印象深刻,这个解决方案为MedGenome提供并扩大了在罕见疾病和帕金森氏症,以及其他领域研究所需的运算能力。」GARAOTUS提供的基因组分析解决方案,能有效将100人的全基因组定序(Whole genome sequencing, WGS)研究时间缩短到三分之一。

随着人体基因分析、疫苗及新药的开发应用越来越多且复杂,研究人员需要处理与分析的流程及数据量更是多样及多元。在缺乏视觉化、模组化与整合性的资料分析处理下.将面临多种在资料导入及整合上的困境,更无法有效推动研究的进行。

为协助解决此一难题,GARAOTUS提供的CRONUS平台,让研究人员不须编写程式,就可以运用视觉化介面以拖拉方式轻松进行资料分析及资讯储存。同时,资料也能够在组织间轻松的交换及协作,透过统一的平台及弹性的权限设计,让整体流程及研究成果更易於管理,也方便研究成果重现及再利用,藉此让非IT程式背景的研究人员,降低研究门槛,更能灵活运用研究资讯。

GARAOTUS团队负责人薛圣杰指出:「研究统计中发现,企业或机构在建置HPC技术时,有将近七成的时间都花在软硬体的校对调整,相对的,研究人员只有三成的时间能放在核心业务。GARAOTUS平台服务的最大优势在於,能协助完备机构所需的HPC整体系统架构建置,在介面上也降低程式指令的困难度,并转化为视觉化的图像。GARAOTUS在成立初期,即锁定朝向国际发展,从过去落地台湾大型教学医院,再来协助香港中文大学进行基因定序研究,很开心CRONUS产品也能在印度新兴市场落地,为MedGenome提供HPC相关解决方案,未来GARAOTUS也将持续与国际生态圈夥伴合作,共同发展更多成功案例。」

CRONUS的平台优势包括采用了HPC技术的底层架构,并向上延伸到服务层,提供了GAPaaS (Genomics-Analytics-Process-as-a-Service)的视觉化服务,未来GARAOTUS将持续携手各领域生态圈夥伴提供服务,包括过去投入的精准医疗与大气服务,下个阶段更将着眼助攻半导体晶片的研发制程、全自动智慧制造应用,以及金融高性能计算的数值方法应用等,助力各产业与高速运算技术接轨。

GARAOTUS今(2022)年更获得美国全球企业领袖杂志(Global Business Leaders Magazine),评选为全球瞩目的30大企业之一。报导指出,GARAOTUS 提供了具备多样化与包容性的HPC解决方案,并涵盖了许多开源技术的应用。

多年来,团队在开源组织社群发挥举足轻重的作用,也曾经在2021年获颁亚洲企业组织(Enterprise Asia)的IIA国际创新奖,是第一个因HPC技术获得此奖项的团队。未来团队将持续以HPC技术为基础,扩展解决方案组合,建构各行业应用平台层,让各产业能无缝对接HPC所提供的「算力」,加速实现数位转型。

關鍵字: 精诚集团  GARAOTUS 
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