當台灣與世界各國仍苦於爭取BioNTech新冠病毒（Covid-19）疫苗而不可得，總部設在美因茨的BioNTech生物技術公司工廠於2020年秋季也添購了一套設施，已具備製造生物技術物質的能力，並從2月份以來持續生產疫苗BNT162b2（也稱為COMIRNATY）。西門子公司則基於多年來與BioNTech有著悠久的合作夥伴合作傳統，在生產Covid-19疫苗方面展現了雙方的互信及互助，以史上最快速度將BioNTech生物技術公司位於瑪律堡的既有工廠轉換成生產Covid-19疫苗的設施。

BioNTech SE生物技術公司在西門子的協助下，在創紀錄的時間內改造了生產Covid-19疫苗的現有設施

借助西門子和瑪律堡現場專家團隊合作導入關鍵的製造執行的系統（MES），讓整個專案時程減少了2.5月的時間，不僅順利將BioNTech現有生產mRNA疫苗的設施轉換成生產Covid-19疫苗的專案時程表從大約1年縮短到5個月；且因為最新生產系統和各分站間的資料傳遞數位化，使之生產轉換為「無紙化生產流程」，得以立即滿足所有對生產資料的法規要求。

西門子表示，BioNTech所有製程皆使用西門子自動化產品Simatic PCS 7作業控制系統修改並實現自動化，再由運營中心執行製藥MES，用於協調子系統和流程控管，並分析其品質，可在生產過程中自行開發、優化和管理。尤其是mRNA流程包括許多手動工作步驟，例如稱重，因為精確測量重量對產品品質至關重要，現在西門子自動化稱重系統已可執行這些步驟，。

在自動控制和調節系統的整個過程。西門子也提供了其他產品，包括有線網路、無線WLAN接入點、通信技術和TIA（全方位整合自動化）的工程框架。在BioNTech啟動生產Covid-19疫苗生產的專案裡，西門子提供了更深入的服務，和隨叫隨到的合作模式。